Chociaż zarówno glukometr, jak i system ciągłego monitorowania glikemii dostarczają informacje o poziomie glukozy we krwii to w pewnym stopniu różnią się od siebie:

Częstotliwość pomiaru Częstotliwość uzyskiwania wartości glukozy różni się w przypadku korzystania z glukometru i systemu ciągłego monitorowania glikemii. W przypadku glukometru poziom glukozy we krwi
jest mierzony kilka razy w ciągu dnia, zazwyczaj przed posiłkiem i przed snem, w zależności od typu cukrzycy i stosowanych leków.

W systemie ciągłego monitorowania glikemii poziom glukozy jest mierzony w sposób ciągły. Wartości glukozy mierzone przez czujnik umieszczony podskórnie i są przesyłane co 5 minut oraz są łączone, aby utworzyć krzywą glukozy. W czasie noszenia czujnika uzyskuje się pełnniejszy obraz poziomu glukozy.

Pomiar poziomu glukozy we krwi a pomiar w płynie śródmiąższowym

Glukometr i system ciągłego monitorowania glikemii różni też miejsce pomiaru poziomu glukozy. Glukometr mierzy glukozę we krwi kapilarnej pobranej z opuszki palca (lub czasami z innych miejsc takich jak dłoń). Czujnik systemu ciągłego monitorowania glikemii umieszcza się podskórnie, właśnie tam

dochodzi do pomiaru poziomu glukozy w płynie znajdującym się między komórkami (w płynie śródmiąższowym, nie we krwi).